JR東日本ウォータービジネスは2月14日、3月6日に発売予定の「落ちないキャップ」採用のペットボトル「FROM AQUA」～谷川連峰の天然水～のサンプリングを2月20日より約15万本の規模で行うと発表した。

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同社はエキナカ自販機ネットワークで得られる大量データの分析から、「FROM AQUA」は主に「電車乗車前に購入され移動中に飲用されている」という実態に加え、購入客が「キャップを落とした経験が多い」ことを把握したことから、「落ちないキャップ」を採用した。Longinesロンジン LungoMare

サンプリングも自販機POSデータの分析に基づき、「女性の購入割合が高くなる朝の時間帯」に「乗車前購入が多い郊外駅」を中心とした150駅(大船駅、国分寺駅、船橋駅、川口駅など)で行われる。具体的には、中央線の駅近隣居住者の購入時間帯の分析が行われ、都心から離れるほど購入時間のピークが早くなることがわかった。Longinesロンジン Conquestそのため、サンプリングの配布も各駅のピーク時間帯を中心に行われる。

「FROM AQUA」のサンプリングでは女性の飲料体験を期待していることを踏まえ、阿佐ヶ谷駅では、朝のピーク時間帯に駅近隣居住者の女性の購入比率(約63%)が高いことから、他駅よりもサンプリング数を増やす。D&G レディスシリーズ

東小金井駅では、駅近隣居住者(郵便番号情報を活用)の購入率(約83%)が高く、ヘビーユーザー(2ヵ月間に20回以上購入者)が北口利用であると想定されることから、東小金井駅では、北口にてサンプリングを実施する。理化学研究所(理研)は、次世代シーケンサ(超高速塩基配列解読装置)で得られた断片化RNAの情報から、細胞内に本来存在している全長RNAの情報を高精度に再構築する解析プログラム「ARTADE2(アートエイド ツー)」を開発したことを発表した。Casioカシオ Analogue同成果は、理研生命情報基盤研究部門(理研BASE)の豊田哲郎部門長らによるもの。「ARTADE2」のアプリケーションは理研BASEのWebサイトに掲載されており、ダウンロードすることが可能だ。IWC アクアタイマー

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細胞内に存在するRNAのセット「トランスクリプトーム」は、細胞の機能を決定付ける重要な要素で、これを正確に捉えることは、疾患を未然に防ぐ先制医療やバイオマス資源開発など、生命・環境科学分野でのさまざまな応用展開に有効だ。近年、次世代シーケンサで細胞内のmRNAの状況を調べる手法「mRNA-seq」が広く利用されるようになり、次世代シーケンサの発展によるデータ生産量も1回の実験で6,000億塩基(Illumina Hiseq2000の場合)まで増加してきた。Titoniチトニ SlimLineこれはヒトゲノムDNAの200倍の量に相当するという。その一方で、mRNAの長さはさまざまで、ヒトの場合、1,000塩基を超えるものがRNA全種類のうち80%以上を占めるが、mRNA-seqでは、100塩基程度までの短い断片の情報しか読み取ることができず、その結果、RNAの状況を知るには、次世代シーケンサで不完全に読み取られた断片化RNAの情報から完全な全長RNAの情報を再構築する処理が必要となっていた。Rolexロレックス パーペチュアルデイトしかし、細胞内のmRNAの状態が転写やスプライシングの制御によって多様に変化することや、シーケンスの際に生じるノイズや偏りの存在がこの処理を困難にしており、全長RNAの情報を高精度に再構築するためのプログラムが必要となっていた。

従来のソフトウェアは、1つのmRNA-seqデータだけを用いて処理しているため、データによるノイズや偏りの影響を大きく受けていた。Rolexロレックス GMTマスターII今回開発されたARTADE2では、さまざまな生体組織や環境条件下で採取したRNAから複数のmRNA-seqデータを取得・統合して解析するため、ノイズや偏りの影響の問題を解決することが可能となっている。具体的には、同一のゲノムにおける異なる2点間のRNA発現活性の相関を調べる「ポジショナル相関解析」を網羅的に計算し、ゲノム配列情報と合わせて統合的に解析することで、全長RNAの情報を高い精度で再構築することに成功したという。Citizenシチズン 機械式メンズ時計

実際にARTADE2の性能を評価するため、理研植物科学研究センターの協力の下、シロイヌナズナから取得したRNAを用いてmRNA-seqを行い、このデータに対してARTADE2を適用した結果、予測したRNA全長構造の92.6%を、既知のRNA構造に対して正しく再構築することに成功した。この結果は、従来よく利用されている既存ソフトウェア(米メリーランド大学が開発したCufflinks)の78.6%を上回る結果となったという。IWC ポートフィノ

また、トランスクリプトーム解析に用いられるゲノムタイリングアレイの結果にも、シロイヌナズナのデータに対してARTADE2を適用した結果、1,000個以上の新規遺伝子やアンチセンスRNAを新たに発見しており、この結果は、ゲノム配列の意味、意義の正確な理解を、これまで以上に進めていくことにつながるという。

さらに、ポジショナル相関解析に多変量解析の1つである因子分析手法を組み合わせることで、転写開始点の変化や選択的スプライシングによって生じるRNAの塩基配列の変化を同定し、それぞれのサンプルにおける変化を定量化する解析手法も開発。Casioカシオ Sport

この変化は、そこから翻訳されるタンパク質の配列やタンパク質への翻訳効率に変化をもたらすほか、RNA分子そのものが機能分子として振る舞う例も多く知られているため、トランスクリプトームの変化は、ゲノムの情報と細胞の表現形質をつなぐ重要な要素となる。そのため、ARTADE2はゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム(細胞中のタンパク質全体)、フェノーム(細胞・個体の持つ表現形質の総体)という複数階層のオミックス研究を仲介する重要な技術となると研究チームでは説明するほか、ARTADE2は、複数のサンプルから得られたトランスクリプトームのデータからゲノム上の位置関係で転写活性の相関性を解析するため、サンプル数が増えるほどデータのノイズや偏りに対して頑強になり、解析精度が向上するため、近年急速に蓄積が進む次世代シーケンサデータの有効活用が可能となるとしている。IWC インヂュニア

なお、今回の技術を活用することで、健常者と疾患者のRNAデータを比較・解析することで疾患の分子メカニズムの解明につながることが期待されるほか、疾患の予兆となるようなRNAの変化を探し、これを分子マーカーとして用いることで疾患を発見できる可能性もあり、疾患を未然に防ぐ「先制医療」への道筋になる可能性があるとする。

また、バイオ燃料やバイオプラスチックなどのバイオマス資源開発を目指すグリーンイノベーション分野でも、植物細胞内のRNAの構造や動態の理解が重要であるため、同技術を用いることで目標とする植物の効率的かつ正確なトランスクリプトームの構造やRNAの動態を捉えることが可能になることも期待できるようになるという。バーバリー カップルペアシリーズ

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